Las líneas de investigación de la maestría/doctorado se enfocan en los siguientes campos del conocimiento: Caracterización de la Biodiversidad, Biología de la Conservación, Biología Aplicada y Biotecnología, y Genética y Evolución.
Las líneas de investigación y las áreas del conocimiento han promovido acciones que minimizan la degradación ambiental, la creación de áreas de conservación, medición del impacto ambiental de áreas en desarrollo, la caracterización de la biodiversidad, el desarrollo de métodos de diagnóstico molecular, análisis microbiológico y la aplicación de la biotecnología a la solución de problemas regionales y nacionales, entre otros. Esta visión se enmarca en la importancia de la investigación biológica básica y aplicada a nivel nacional buscando así una conjunción entre la academia, los gremios productivos y el gobierno.
Biología Marina:
Botánica:
Entomología:
Genética:
Zoología:
Interdisciplinario: