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Profesor Titular

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Teléfono +60 2 321 21 00, ext. 7068

Espacio E20 - 4040,  Sección Genética

Grupo de Investigación  Genética Molecular Humana-GMH

Redes Científicas

Estudios

Ph.D. Biología Molecular. Universidade Federal De Minas Gerais, Brasil. 1995
M.S. Genética. Universidade Federal Do Rio Grande Do Sul, Brasil. 1990
B.S. Biología. Universidad del Valle, 1981

Líneas de Investigación

Genética y Genómica de Poblaciones Humanas
Caracterización de genes comprometidos con patologías
Generación y transferencia de tecnologías genómicas
Diversidad genética animal"

Perfil

Genetista con áreas de concentración en Genética Humana y Biología Molecular. Dicta diferentes cursos a nivel de pregrado y postgrado.

El énfasis en investigación se concentra en el estudio de la diversidad genética humana tanto patológica como normal. Actualmente estudia la diversidad genética de comunidades indígenas de la Amazonía colombiana y del Sur Occidente colombiano. También trabaja en la caracterización de mutaciones implicadas con cáncer de mama y/u ovario familiar en Colombia. Igualmente hemos realizado proyectos de investigación encaminados al estudio molecular de la anemia de células falciformes.

Desde hace más de 15 años coordina el Servicio de Extensión a la comunidad, que ofrece la Universidad del Valle, donde se realizan pruebas de diagnóstico molecular y de determinación de la paternidad.

Lidera el grupo de investigación “Genética Molecular Humana”, código Colciencias 0005412, donde trabajamos junto con estudiantes de Doctorado, Maestría, Pregrado y técnicas de laboratorio en problemas relevantes de la Genética Humana utilizando para ello tecnologías genómicas.

Proyectos en ejecución

Diversidad genética en comunidades Amerindias de la Amazonía Colombiana: estudio comparativo entre agricultores y cazadores – comunidades recolectoras usando marcadores moleculares ligados al cromosoma Y. Utilizando herramientas moleculares como secuenciación de ADN y análisis de fragmentos nos concentramos en el estudio de las comunidades indígenas de la Amazonía Colombiana y del Sur-Occidente colombiano. A futuro pretendemos entender cómo es la diversidad genética de la población colombiana si consideramos el alto grado de mezcla y las diferentes vías de entrada que las poblaciones fundadoras pudieron tener. Para esto hemos iniciado con el estudio de las comunidades indígenas de la Amazonía y del Sur-Occidente colombiano. También estamos trabajando con comunidades afrodescendientes a objeto de analizar su diversidad genética.

Aspectos moleculares de la anemia de células falciformes en Colombia. Estamos trabajando aspectos moleculares y antropológicos de la anemia de células falciformes. Temas: frecuencia de haplotipos y su distribución en Colombia, regulación de los niveles de hemoglobina fetal, mezcla de poblaciones y SCD y la protección conferida por los heterocigotos para la SCD en zonas de malaria.

Caracterización mediante secuenciación de mutaciones en genes de alta y baja penetrancia en familias colombianas con cáncer de mama. Este proyecto pretende definir el perfil mutacional para Colombia en los genes de alta penetrancia BRCA1 y BRCA2 y en otros de baja penetrancia. Se identificarán las mutaciones que son únicas de la población colombiana y las que son compartidas. Mediante análisis in silico se definirá el grado de severidad de cada variante génica.

Intereses de Docencia

Dicta cursos a nivel pregrado, Maestría y Doctorado. En el pregrado dicta los cursos de Biología Molecular y Genética Humana. En la Maestría y Doctorado ministra los cursos de Tópicos Avanzados en Genética y el de Genética Molecular Humana.

Intereses de Investigación

Sus principales líneas de investigación son: el estudio de la diversidad genética en poblaciones humanas, la caracterización de los genes implicados en enfermedades hereditarias y la generación y transferencia de tecnologías con el objetivo de estudiar el genoma humano. En relación a la primera línea, inicialmente el énfasis es el estudio de las poblaciones amerindias, teniendo como objetivo a futuro generar una visión de cómo es la estructura genética de la población colombiana. Actualmente, se está trabajando con comunidades indígenas de la Amazonía y del Suroccidente colombiano. Respecto a la segunda línea, se está estudiando el cáncer de mama familiar con el objetivo de encontrar mutaciones en genes de alta y baja penetrancia. Adicionalmente, se trabajan aspectos moleculares y antropológicos de la anemia de células falciformes. Siendo de su interés también el diagnóstico molecular de enfermedades genéticas.

Estudiantes

Estudiantes graduados:
Pregrado: 30
Postgrado: 20
Doctorado: 5
Maestría: 15
Postdoctorandos: 1, procedente de la Universidad de Burdeoux, Francia.

Estudiantes en curso:
Pregrado: 3
Postgrado en Ciencias - Biología: 10 realizan estudios de postgrado
Doctorado: 3
Maestría: 7
Postgrado en Ciencias Biomédicas: 1

Redes científicas

Publicaciones escogidas

Pena, S.D.J., Barreto, G., Vago, R. A., De Marco, L., Reinach, F.C., Dias Neto, E. & Simpson, A. 1994. Sequence-specific "gene signatures" can be obtained by PCR with single specific primers at low stringency. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA (PNAS) 91: 1946 - 1949.

Barreto, G., Vago, R.A., Simpson, A.J.G. & Pena, S.D.J. (1996) Mitochondrial D-Loop "signatures" produced by low-stringency single specific primer PCR (LSSP-PCR) constitute a simple and effective human identity test. The American Journal of Human Genetics. 58: 609-616.

L. Porras, C. Phillips, M. Fondevila, L. Beltra´n, T. Ortiz a, F. Rondon, Barreto, G.., M.V. Lareu, J. Henao- A. Carracedo. 2009. Genetic variability of the SNPforID 52-plex identification-SNP panel in Central West Colombia. Forensic Science International: Genetics 4: e9 – e10.

Fernando Rondón, Julio César Osorio, Angela Viviana Peña, Héctor Andrés Garcés y Guillermo Barreto. 2008. Diversidad genética en poblaciones humanas de dos regiones colombianas. Colombia Médica 39 (2) (Supl. 2): 52 – 60.

Joshua Mark Galanter, M.D.; Juan Carlos Fernandez; Christopher R. Gignoux; Jill Barnholtz-Sloan; Ceres Fernandez; Marc Via; Alfredo Hidalgo-Miranda; Alejandra V. Contreras; Laura Uribe Figueroa; Paola Raska; Gerardo Jimenez-Sanchez; Irma Silva Zolezzi; Maria Torres; Clara Ruiz Ponte; Yarimir Ruiz; Antonio Salas; Elizabeth Nguyen; Celeste Eng; Lisbeth Borjas; William Zabala; Guillermo Barreto and Angel Carracedo 2012. 'Development of a Panel of Genome-Wide Ancestry Informative Markers to Study Admixture Throughout the Americas. PLoS Genetics 8(3) e1002554: 1-16.

Cristian Fong, María Alejandra Lizarralde-Iragorri, Diana Rojas-Gallardo and Guillermo Barreto. 2013. Frequency and origin of haplotypes associated with the beta-globin gene cluster in individuals with trait and sickle cell anemia in the Atlantic and Pacific coastal regions of Colombia. Genetics & Molecular Biology 36 (4): 494-497.

Laura Smeldy Jurado Medina, Marina Muzzio, Marisol Schwab, María Leticia Bravi Constantino, Guillermo Barreto and Graciela Bailliet. 2014. .Human Y- chromosome SNP characterization by Multiplex amplified product-length polymorphism analysis. Electrophoresis 35 (17): 2524-2527. DOI: 10.1002/elps.201400020

Cristian Fong, Stephan Menzel, María Alejandra Lizarralde, Guillermo Barreto. 2015 Genetic variants associated with fetal hemoglobin levels show the diverse ethnic origin in Colombian patients with sickle cell anemia. Biomédica. 35(3): 437 – 443.

Diana Carolina Ortega, Cristian Fong, Héiber Cárdenas and Guillermo Barreto. 2015. Evidence of over-dominance for sickle cell trait in a population sample from Buenaventura, Colombia. International Journal of Genetics and Molecular Biology 7(1): 1 – 7. DOI: 10.5897/IJGMB.20140106. ISSN: 2006-9863.

Leslie A. Castillo Cutiva, Alan Giraldo, Guillermo Barreto. 2014. Genetic Diversity in a Population of Rhinoclemmys nasuta (Testudines:Geoemydidae) Associatted with an Insular Locality in the Chocó Biogeographic Region. Acta Biológica Colombiana 19(3): 513-519. ISSN 0120-548X.

Oscar Sierra-Fitzgerald (q.e.p.d), Guillermo Barreto, Francisco Lopera-Restrepo. 2013. Ausencia de efecto cognitivo APOE en personas sanas de edad mediana. Acta Neurol Colomb 29(3): 163 – 172. ISSN 0120 8748

Lorena Cruz-Bernate, Yilton Riascos, & Guillermo Barreto. 2013. Dimorfismo sexual y determinación del sexo con DNA en el pellar común (Vanellus chilensis). Ornitología Neotropical 24: 433-444.

Yamid Braga, Leonardo Arias B and Guillermo Barreto. 2012. Diversity and genetic structure analysis of three Amazonian Amerindian populations from Colombia. ColombiaMédica 43(2): 134 – 141.

Luz Angela Alvarez, Víctor J. Vera, Héiber Cárdenas, Guillermo Barreto y Jaime Muñoz. 2012. Assessing the genetic diversity and ancestry of Hartón del Valle Cattle using mitochondrial DNA. RCCP Revista Colombiana de Ciencias Pecuarias 25: 14 -26.

Versión Español

Guillermo Barreto

Full Professor

E-mail Esta dirección de correo electrónico está siendo protegida contra los robots de spam. Necesita tener JavaScript habilitado para poder verlo.

Telephone +60 2 321 21 00, ext. 7068

Section Genetics, E20 - 4040

Research group  Human Molecular Genetics-GMH

Scientific Networks

Studies

Ph.D. Molecular Biology. 1995. Universidade Federal De Minas Gerais. Brasil.
M.S. Genetics. 1990. Universidade Federal Do Rio Grande Do Sul. Brasil.
B.S. Biology. 1981. Universidad del Valle, Cali, Colombia.

Professional Profile

Geneticist specializing in human genetics and molecular biology, and teaching both graduate and undergraduate courses. Research emphasis is on the study of human genetic diversity, the characterization of the genes involved in hereditary illnesses and the generation and transfer of technologies for the study of the human genome. In the first line of research, the initial study is of genetic diversity among Amerindian populations in the Colombian Amazon and the Colombian Southwest, a future objective being the generation of a vision of the genetic structure of the population of Colombia. The second line of research includes the study of breast cancer in families in order to find genes of high and low penetrance, and research projects focused on the study of molecular and anthropologic aspects of falciform cell anemia as well molecular diagnosis of genetic illnesses.

For more than 15 years, the professor coordinates a Universidad del Valle Community Extension Service that applies molecular diagnostic tests and tests to establish paternity, and is the leader of the “Human Molecular Genetics Group”, Colciences code 0005412, which includes Doctoral, Masters, and undergraduate students as well as and laboratory technicians. Through the use of genomic techniques, work is being carried out on problems related to human genetics.

Projects in Process

Genetic diversity in Amerindian communities in the Colombian Amazon: a comparative study of farmers and hunters – collector communities, using molecular markers linked to the Y chromosome. Using molecular tools such as DNA sequencing and analysis of fragments to concentrate on the study of the native communities of the Colombian Amazon and the Colombian Southwest. In the future, the proposal is to achieve an understanding of the genetic diversity of the Colombian population, considering the high degree of mixing and the various entrance routes the founding population may have had. For this purpose, the study began with the native communities of the Amazon and of Southwestern Colombian. Work is also being carried out with afro-descendent communities in order to analyze their genetic diversity.

Molecular aspects of falciform cell anemia in Colombia. Work is being done on molecular and anthropological aspects of falciform cell anemia. Topics: Frequency of haplotypes and their distribution in Colombia, regulation of levels of fetal hemoglobin, population mix and SCD and the protection conferred by the hipocygotes for SCD in malaria areas.

Characterization by sequencing of gene mutations with high and low penetrance in Colombian families with breast cancer. This project attempts to define the mutational profile of high penetration BRCA1 and BRCA2 genes for Colombia, and of those which are shared. The degree of severity of each genetic variety will be defined by analysis in silico.

Teaching and Research Interests

The professor is in charge of the Advanced Topics in Genetics and Human Molecular Genetics courses in the graduate program, and Human Molecular Genetics for the undergraduate program.


Students

Number of students graduated: 20 postgraduate students ( 5 Doctoral and 15 Master´s), and 30 undergraduate students.

Postdoctoral: 1 from the University of Burdeoux, France.

Active students in the graduate program in Sciences – Biology: 10 postgraduate (3 doctoral level and 6 in a Master´s program). Another MA is from the graduate program in Biomedical Sciences.

Scientific Networks

Selected Publications

Pena, S.D.J., Barreto, G., Vago, R. A., De Marco, L., Reinach, F.C., Dias Neto, E. & Simpson, A. (1994). Sequence-specific "gene signatures" can be obtained by PCR with single specific primers at low stringency. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA (PNAS) 91: 1946 - 1949.

Barreto, G., Vago, R.A., Simpson, A.J.G. & Pena, S.D.J. (1996) Mitochondrial D-Loop "signatures" produced by low-stringency single specific primer PCR (LSSP-PCR) constitute a simple and effective human identity test. The American Journal of Human Genetics. 58: 609-616.

Fernando Rondón, Julio César Osorio, Angela Viviana Peña, Héctor Andrés Garcés and Guillermo Barreto. (2008). Diversidad genética en poblaciones humanas de dos regiones colombianas. Colombia Médica 39 (2) (Supl. 2): 52 – 60.

L. Porras, C. Phillips, M. Fondevila, L. Beltran, T. Ortiz a, F. Rondon, Barreto, G., M.V. Lareu, J. Henao- A. Carracedo. (2009). Genetic variability of the SNPforID 52-plex identification-SNP panel in Central West Colombia. Forensic Science International: Genetics 4: e9 – e10.

Joshua Mark Galanter, M.D.; Juan Carlos Fernandez; Christopher R. Gignoux; Jill Barnholtz-Sloan; Ceres Fernandez; Marc Via; Alfredo Hidalgo-Miranda; Alejandra V. Contreras; Laura Uribe Figueroa; Paola Raska; Gerardo Jimenez-Sanchez; Irma Silva Zolezzi; Maria Torres; Clara Ruiz Ponte; Yarimir Ruiz; Antonio Salas; Elizabeth Nguyen; Celeste Eng; Lisbeth Borjas; William Zabala; Guillermo Barreto and Angel Carracedo. (2012). Development of a Panel of Genome-Wide Ancestry Informative Markers to Study Admixture throughout the Americas. PLoS Genetics 8(3) e1002554: 1-16.

Luz Angela Alvarez, Víctor J. Vera, Héiber Cardenas, Guillermo Barreto and Jaime Muñoz. (2012). Assessing the genetic diversity and ancestry of Hartón del Valle Cattle using mitochondrial DNA. RCCP Revista Colombiana de Ciencias Pecuarias 25: 14 -26.

Yamid Braga, Leonardo Arias B and Guillermo Barreto. (2012). Diversity and genetic structure analysis of three Amazonian Amerindian populations from Colombia. Colombia Médica 43(2): 134 – 141.

Oscar Sierra-Fitzgerald (q.e.p.d), Guillermo Barreto, Francisco Lopera-Restrepo. (2013). Ausencia de efecto cognitivo APOE en personas sanas de edad mediana. Acta Neurol Colomb 29(3): 163 – 172. ISSN 0120 8748.

Lorena Cruz-Bernate, Yilton Riascos, and Guillermo Barreto. (2013). Dimorfismo sexual y determinación del sexo con DNA en el pellar común (Vanellus chilensis). Ornitología Neotropical 24: 433-444.

Cristian Fong, María Alejandra Lizarralde-Iragorri, Diana Rojas-Gallardo and Guillermo Barreto. (2013). Frequency and origin of haplotypes associated with the beta-globin gene cluster in individuals with trait and sickle cell anemia in the Atlantic and Pacific coastal regions of Colombia. Genetics & Molecular Biology 36 (4): 494-497.

Leslie A. Castillo Cutiva, Alan Giraldo, Guillermo Barreto. (2014). Genetic Diversity in a Population of Rhinoclemmys nasuta (Testudines:Geoemydidae) associatted with an Insular Locality in the Chocó Biogeographic Region. Acta Biológica Colombiana 19(3): 513-519. ISSN 0120-548X.

Laura Smeldy Jurado Medina, Marina Muzzio, Marisol Schwab, María Leticia Bravi Constantino, Guillermo Barreto and Graciela Bailliet. (2014). Human Y- chromosome SNP characterization by Multiplex amplified product-length polymorphism analysis. Electrophoresis 35 (17): 2524-2527. DOI: 10.1002/elps.201400020.

Cristian Fong, Stephan Menzel, María Alejandra Lizarralde, Guillermo Barreto. (2015). Genetic variants associated with fetal hemoglobin levels show the diverse ethnic origin in Colombian patients with sickle cell anemia. Biomédica. 35(3): 437 – 443.

Diana Carolina Ortega, Cristian Fong, Heiber Cárdenas and Guillermo Barreto. (2015). Evidence of over-dominance for sickle cell trait in a population sample from Buenaventura, Colombia. International Journal of Genetics and Molecular Biology 7(1): 1 – 7. DOI: 10.5897/IJGMB.20140106. ISSN: 2006-9863.