Facultad de Ciencias Naturales y Exactas

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Martes, 13 Agosto 2019 16:52

Taller gratuito para egresados de Biología: mutaciones puntuales de proteínas (Aplicaciones de las Ciencias Ómicas)

El programa de egresados de la Facultad de Ciencias Naturales y Exactas invita a los egresados de Biología a participar en el Taller de bioinformática de mutaciones no sinónimas, que se realizará el sábado 17 de agosto, a cargo del profesor Andrés Castillo Giraldo de la sección de Genética.

Lugar: Facultad de Ciencias Naturales y Exactas (E20, piso 1)
Horario: sábado 17 de agosto de 8:00 a.m. a 12:00 m.
Certificación: De asistencia
Valor: Gratuito (el taller es para egresados de los programas del Departamento de Biología)
Inscripciones: cupo limitado (20 personas)
Informes: Esta dirección de correo electrónico está siendo protegida contra los robots de spam. Necesita tener JavaScript habilitado para poder verlo.

Sobre el Taller

Con la llegada de las nuevas tecnologías de secuenciación masiva se ha incrementado el número de mutaciones no sinónimas identificadas, que generan sustituciones en los aminoácidos de las proteínas y, por ende, posibles cambios en sus estructuras y función. Lo anterior ha generado que en la actualidad exista más genotipos que fenotipos observados, lo que conlleva a la necesidad de plantear algoritmos computacionales para poder predecir los efectos en el fenotipo molecular de las proteínas con programas bioinformáticos disponibles gratuitamente en Internet.
Estudios previos han sugerido que los efectos de las mutaciones puntuales sobre la estructura de la proteína (y por tanto la función) dependen en parte de dónde se produzcan. No tiene el mismo efecto cambiar un aminoácido en una región de giro en una proteína, o uno que este junto con otro de un lazo vecino. Del mismo modo, una sustitución en el interior de una hélice alfa no se puede comparar con la eliminación de un residuo catalítico o de otra clave para interaccionar con otras proteínas. Así, medir la estabilidad que tienen mutaciones individuales dependiendo de su contexto de estructura, ya sea secundaria o terciaria, se torna importante para entender si la mutación afecta la función de la proteína y por ende puede ser ventajosa o no para el individuo portador de la misma.

Objetivo general

Determinar el efecto de las mutaciones no sinónimas con el uso de servidores bioinformáticas online para predecir los cambios estructurales y funcionales en una proteína.

Objetivos específicos:

  1. Realizar en sustituciones de aminoácidos un análisis predictivo bioinformático con el servidor Mutation assessor (http://mutationassessor.org/r3/) dirigidas a determinar las regiones conservadas de los aminoácidos y el impacto funcional en la proteína si la mutación ocurre en estas regiones.
  2. Realizar en sustituciones de aminoácidos un análisis predictivo bioinformático con el servidor PROVEAN (http://provean.jcvi.org/protein_batch_submit.php?species=human) dirigidas a determinar la naturaleza de los aminoácidos, tolerancia al cambio del aminoácido programa SIFT y el impacto funcional en la proteína si la mutación ocurre en esta posición de aminoácido.
  3. Realizar en sustituciones de aminoácidos un análisis predictivo bioinformático con el servidor SusPect (http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/~suspect/index.html) dirigidas a determinar la naturaleza de los aminoácidos y si la sustitución ocurre en una estructura molecular en particular de la proteína y si la impacta funcional.
  4. Realizar en sustituciones de aminoácidos un análisis predictivo bioinformático con el programa visor Swiss-PdbViewer (https://spdbv.vital-it.ch/) dirigidas a determinar si la sustitución ocurre en una estructura molecular en particular de la proteína, como afecta su estabilidad energética, el número de puentes de hidrogeno y cuál es su impacto funcional.